Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NSMCE2Q96MF7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms