Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms