Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms