Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms