Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms