Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTPBP3Q969Y2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms