Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM41Q8WV44 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms