Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms