Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms