Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL4Q6XD76 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms