Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms