Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KCNIP4Q6PIL6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms