Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRRC8EQ6NSJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms