Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms