Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF6Q58WW2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF6Q58WW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms