Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms