Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms