Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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