Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCAPQ14761 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRCAPQ14761 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms