Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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