Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNA1Q09470 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNA1Q09470 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms