Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms