Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms