Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms