Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms