Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms