Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms