Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HBBP68871 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBBP68871 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBBP68871 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBBP68871 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HBBP68871 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms