Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRATP43155 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRATP43155 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRATP43155 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms