Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORAP35398 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORAP35398 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORAP35398 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORAP35398 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORAP35398 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RORAP35398 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RORAP35398 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
RORAP35398 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORAP35398 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORAP35398 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RORAP35398 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms