Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms