Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GADD45AP24522 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms