Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms