Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms