Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT1P13805 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT1P13805 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNT1P13805 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNT1P13805 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms