Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms