Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL18O94889 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL18O94889 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms