Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COBLO75128 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COBLO75128 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COBLO75128 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLO75128 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLO75128 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLO75128 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLO75128 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLO75128 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms