Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms