Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms