Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM2O43147 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms