Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBDO15205 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBDO15205 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBDO15205 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms