Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APAF1O14727 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APAF1O14727 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APAF1O14727 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APAF1O14727 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms