Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCRIP1C9JLW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms