Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms