Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH2D7A6NKC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH2D7A6NKC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms