Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD3B-203ENST00000358768 3432 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TIRAP-201ENST00000392678 1264 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SRMP1-201ENST00000398959 885 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RPLP1P13-201ENST00000434567 299 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2H-206ENST00000452961 791 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM10L2B-AS1-201ENST00000453528 1027 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL304P-201ENST00000488028 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1D-37-201ENST00000509129 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139495.2-201ENST00000514492 1087 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10P13-201ENST00000550757 303 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-28-202ENST00000558026 306 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV2OR16-5-201ENST00000567458 358 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090282.1-202ENST00000575487 515 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4721-201ENST00000577590 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL217P-201ENST00000584520 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC032044.2-201ENST00000623383 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG14-202ENST00000640151 425 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 REEP1-201ENST00000165698 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL096869.3-201ENST00000567837 2626 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms