Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms