Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms