Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms